歯周ポケットの奥にある組織（歯の根面のセメント質）に付着したプラークや歯石、その他のい代謝物質が入り込んだ病的な表面部分を取り除く処置で、スケーリングに加えておこないます。スケーラーを使って根面をなめらかに整えることで、プラークが再び歯に付着しにくくなります。また、歯肉と歯の根面がくっつきやすくなることで歯周ポケットが浅くなる効果が期待できます。

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なお、スケーリングやルートプレーニングをおこなった後は一時的に知覚過敏症が起こりやすくなります。これは棍面がきれいになって一部、露出をすることで、外部からの刺激を受けやすくなるためです。数日たつとおさまってきますが、症状が強い場合は知覚過敏治療薬を塗って症状の改善をします。